小６は公立中高一貫コース
都立の一貫校を目指すのであれば、都立中高一貫校コースのほうが良いような気がします。
ただし、併願で私立中学も受験するのであれば、私立受験コースの方が良いです。
小石川や武蔵といった難関の一貫校の場合、かなりの割合が私立受験コースからの合格者です。
とは言え、私立は受けず公立一貫校のみを受験するお子さんは、やはり公立一貫のコースが良いでしょう。
私としては、小５までは私立受験コースにいて小６から公立一貫コースに行くのをお奨めします。
ただし、私立も併願する場合、私立受験コースに通いつつ公立一貫校の望校別対策講座も取るというのが良いと思います。